Hakkımızda About Hizmetler Services Süreç Process İletişim Contact
Hassas Onkoloji Çözümleri
Precision Oncology Solutions

Tümör Biyolojisini
Veriye
Dönüştürüyoruz

Translating Tumor
Biology into
Actionable Data

CTC izolasyonu, hasta kaynaklı organoid ilaç testleri, multi-omik analizler ve metagenomik çözümlerle translasyonel araştırma ekiplerine uçtan uca hizmet sunuyoruz.

End-to-end services for translational research teams — CTC isolation, patient-derived organoid drug testing, multi-omic analyses and metagenomic solutions.

🩸

CTC İzolasyonu

CTC Isolation

Liquid biopsy tabanlı tümör hücresi izolasyonu

Liquid biopsy-based tumor cell isolation

🫁

PDO İlaç Testleri

PDO Drug Testing

Hasta kaynaklı organoid ilaç duyarlılık taraması

Patient-derived organoid drug sensitivity screening

🧫

Multi-Omik Analiz

Multi-Omic Analysis

NGS tabanlı entegratif genomik çözümler

NGS-based integrative genomic solutions

🦠

Metagenomik

Metagenomics

Mikrobiyom profilleme ve biyoinformatik analiz

Microbiome profiling and bioinformatic analysis

Neden Cellformatics?
Why Cellformatics?

Klinik Araştırmayı Bilimle Buluşturuyoruz

Bridging Clinical Research with Science

GEMHAM Laboratuvarı bünyesinde, Marmara Üniversitesi iş birliğiyle faaliyet gösteren Cellformatics; CTC izolasyonundan multi-omik veri entegrasyonuna kadar geniş bir hizmet yelpazesiyle translasyonel araştırma ve klinik AR-GE ekiplerine destek verir. Memorial Göztepe Hastanesi klinik ortaklığıyla gerçek hasta örnekleri üzerinde geliştirilen standart protokollerimiz, araştırmanızı hızlandırır.

Operating within GEMHAM Laboratory in collaboration with Marmara University, Cellformatics supports translational research and clinical R&D teams across a broad service spectrum. Our standardized protocols, developed on real patient samples through our clinical partnership with Memorial Göztepe Hospital, accelerate your research.

Memorial Göztepe Ortaklığı Marmara Üniversitesi GEMHAM Lab GMP-uyumlu Protokoller
CTC FILTER ISOLATED Circulating Tumor Cell — Liquid Biopsy Isolation
🏥
Klinik Ortaklık
Clinical Partnership

Memorial Göztepe Hastanesi

🎓
Akademik Altyapı
Academic Infrastructure

Marmara Üniversitesi, GEMHAM Lab

Marmara University, GEMHAM Lab

Hizmetlerimiz
Our Services

Uzmanlık Alanlarımız

Our Areas of Expertise

Solid tümörlerden liquid biopsy'ye, hasta kaynaklı modellerden metagenomiğe — translasyonel araştırmanın tüm boyutlarında çözüm.

From solid tumor liquid biopsy to patient-derived models and metagenomics — solutions across all dimensions of translational research.

CTC Peripheral Blood Isolation →
Liquid Biopsy

Solid Tümörlerde CTC Sayımı ve İzolasyonu

CTC Enumeration & Isolation in Solid Tumors

Dolaşımdaki tümör hücrelerinin invaziv olmayan izlenmesi

Non-invasive monitoring of circulating tumor cells

CTCRT-qPCRBiomarker

Periferik kandan CTC zenginleştirme, sayım ve izolasyonu; moleküler analiz ile kültür uygulamalarına uyumlu izolasyon protokolleri ve çalışma tasarımı desteği.

CTC enrichment, enumeration and isolation from peripheral blood; isolation protocols compatible with downstream molecular analysis and culture applications, plus study design support.

Neler Sunuyoruz?
What We Offer
  • Periferik kandan CTC zenginleştirme ve izolasyon
  • CTC enrichment and isolation from peripheral blood
  • CTC sayımı ve raporlanması
  • CTC enumeration and reporting
  • Moleküler analiz ve kültür uygulamalarına uyumlu izolasyon
  • Isolation compatible with molecular analysis and culture
  • Çalışma tasarımı desteği (hasta grupları, zaman noktaları)
  • Study design support (patient groups, time points)
Çıktılar
Outputs
  • Standartlaştırılmış CTC sayım raporu
  • Standardized CTC enumeration report
  • İzole fraksiyonun kalite/uygunluk değerlendirmesi
  • Quality/suitability assessment of the isolated fraction
  • Klinik ve araştırma amaçlı yorumlanabilir özet metrikler
  • Interpretable summary metrics for clinical and research use
👥Onkoloji klinikleri · Cerrahi/medikal onkoloji · Klinik araştırma grupları · Biyoteknoloji ve ilaç AR-GEOncology clinics · Surgical/medical oncology · Clinical research groups · Biotech and pharma R&D
Dose-Response Concentration Viability IC50 Patient-Derived Organoid
Drug Sensitivity

PDO Üretimi ve İlaç Duyarlılık Testleri

PDO Culture & Drug Sensitivity Testing

Tümörün gerçekçi laboratuvar modeliyle fonksiyonel tedavi yanıtı

Functional treatment response with a realistic tumor lab model

PDOIC50/EC50Drug Screening

Hasta tümör örneğinden organoid kurulumu ve biyobankalaması; geniş ilaç paneli üzerinden doz-yanıt temelli tarama; isteğe bağlı genomik/transkriptomik entegrasyon.

Organoid establishment and biobanking from patient tumor samples; dose-response-based screening across broad drug panels; optional genomic/transcriptomic integration.

Neler Sunuyoruz?
What We Offer
  • Hasta tümör örneğinden organoid kurulumu, genişletilmesi ve biyobankalanması
  • Organoid establishment, expansion and biobanking from patient tumor samples
  • Geniş panel üzerinden ilaç/kombine taramalar
  • Single-agent and combination drug screening across broad panels
  • Doz-yanıt analizi (IC50/EC50, yanıt sınıflaması)
  • Dose-response analysis (IC50/EC50, response classification)
  • Genomik/transkriptomik entegratif yorum (isteğe bağlı)
  • Genomic/transcriptomic integrative interpretation (optional)
Çıktılar
Outputs
  • Standart ilaç duyarlılık raporu (doz-yanıt eğrileri, yanıt sıralaması)
  • Standard drug sensitivity report (dose-response curves, response ranking)
  • PDO üretim ve kalite kontrol teknik raporu
  • PDO production and quality control technical report
  • Klinik/araştırma kararlarını destekleyen yorumlanabilir sonuç özeti
  • Interpretable result summary supporting clinical/research decisions
👥Klinisyenler · Translasyonel araştırma laboratuvarları · İlaç geliştirme ve repurposing ekipleriClinicians · Translational research labs · Drug development and repurposing teams
Expression Multi-Omics
NGS · Multi-Omics

Genomik & Fonksiyonel Genomik ve Multi-Omik Entegrasyon

Genomic & Functional Genomic Analyses & Multi-Omic Integration

NGS tabanlı uçtan uca biyoinformatik çözümler

NGS-based end-to-end bioinformatics solutions

NGSRNA-seqEpigenomicsProteomics

Genomik, transkriptomik, epigenomik, proteomik ve metabolomik veri analizini tek çatı altında; varyant çağırma, diferansiyel ifade, yolak analizleri ve multi-omik entegrasyon.

Genomic, transcriptomic, epigenomic, proteomic and metabolomic data analysis under one roof; variant calling, differential expression, pathway analyses and multi-omic integration.

Neler Sunuyoruz?
What We Offer
  • Varyant çağırma, anotasyon ve klinik yorumlamaya uygun genomik raporlama
  • Variant calling, annotation and clinically-interpretable genomic reporting
  • RNA-seq: diferansiyel ifade, yolak/ağ analizleri, imza çıkarımı
  • RNA-seq: differential expression, pathway/network analyses, signature extraction
  • Epigenomik: metilasyon/erişilebilirlik analizleri
  • Epigenomics: methylation/accessibility analyses
  • Proteomik/metabolomik: kantifikasyon, istatistiksel analiz ve yorum
  • Proteomics/metabolomics: quantification, statistical analysis and interpretation
  • Multi-omik entegrasyon: ortak biyobelirteçler, hedef adayları, risk katmanlama
  • Multi-omic integration: shared biomarkers, target candidates, risk stratification
Çıktılar
Outputs
  • Tekrarlanabilir tek-omik ve multi-omik analiz raporları
  • Reproducible single-omic and multi-omic analysis reports
  • Makale/proje uyumlu şekiller, tablolar ve yöntem özetleri
  • Publication-ready figures, tables and methods summaries
  • Aday biyobelirteçler ve mekanistik hipotezleri içeren sonuç dosyaları
  • Result files with candidate biomarkers and mechanistic hypotheses
👥Akademik gruplar · Klinik araştırmalar · Biyoteknoloji/ilaç firmaları · Translasyonel tıp ekipleriAcademic groups · Clinical trials · Biotech/pharma companies · Translational medicine teams
α-Diversity Samples Microbiome Profiling
Metagenomics

Metagenomik Veri Üretimi ve Biyoinformatik Analizleri

Metagenomic Data Generation & Bioinformatic Analyses

Mikrobiyal çeşitlilik, fonksiyonel potansiyel, konak–mikrobiyota ilişkileri

Microbial diversity, functional potential and host–microbiota relationships

16S/WGSMicrobiomeDiversity

Metagenomik veri analizinde kalite kontrol, taksonomik ve fonksiyonel profilleme; karşılaştırmalı analizler, çeşitlilik metrikleri ve klinik değişkenlerle entegrasyon.

Quality control, taxonomic and functional profiling in metagenomic data analysis; comparative analyses, diversity metrics and integration with clinical variables.

Neler Sunuyoruz?
What We Offer
  • Çalışma tasarımı danışmanlığı (örnekleme, kovaryatlar, batch etkileri)
  • Study design consulting (sampling, covariates, batch effects)
  • Metagenomik analiz: kalite kontrol, taksonomik ve fonksiyonel profilleme
  • Metagenomic analysis: quality control, taxonomic and functional profiling
  • Karşılaştırmalı analizler: çeşitlilik metrikleri, ilişkilendirme analizleri
  • Comparative analyses: diversity metrics, association analyses
  • Klinik değişkenlerle entegrasyon, çok değişkenli modeller (isteğe bağlı)
  • Integration with clinical variables, multivariate models (optional)
Çıktılar
Outputs
  • Taksonomik/fonksiyonel profiller ve özet istatistikler
  • Taxonomic/functional profiles and summary statistics
  • Yayına uygun grafikler ve yorumlanabilir sonuç raporu
  • Publication-ready graphics and interpretable result report
  • Yeniden üretilebilir analiz çıktıları
  • Reproducible analysis outputs
👥Mikrobiyota araştırmaları · Klinik kohort çalışmaları · Gıda/sağlık biyoteknolojisi · AR-GE ekipleriMicrobiome research · Clinical cohort studies · Food/health biotech · R&D teams
Nasıl Çalışıyoruz?
How We Work

Projeden Rapora: Sürecimiz

From Project to Report: Our Process

Her projeye özel, şeffaf ve tekrarlanabilir iş akışı.

A project-specific, transparent and reproducible workflow.

01

Başlangıç Görüşmesi

Initial Consultation

Proje hedefleri, örnek tipleri ve çalışma tasarımı üzerine detaylı değerlendirme

Detailed assessment of project goals, sample types and study design

02

Protokol Belirleme

Protocol Definition

Projeye özgü SOP ve kalite kontrol parametrelerinin tanımlanması

Definition of project-specific SOPs and quality control parameters

03

Laboratuvar & Analiz

Lab & Analysis

GEMHAM Laboratuvarı altyapısında deneysel uygulama ve veri üretimi

Experimental execution and data generation at GEMHAM Laboratory

04

Biyoinformatik

Bioinformatics

Tekrarlanabilir pipeline'larla analiz, istatistik ve biyolojik yorumlama

Analysis with reproducible pipelines, statistics and biological interpretation

05

Rapor & Teslimat

Report & Delivery

Klinik ve araştırma amaçlı yorumlanabilir, makaleye uygun rapor teslimi

Interpretable, publication-ready reports for clinical or research use

Hedef Kitlemiz
Who We Serve

Kimler İçin Çalışıyoruz?

Who Do We Work With?

🏥

Onkoloji Klinikleri

Oncology Clinics

Tanı, prognoz ve tedavi takibinde liquid biopsy çözümleri

Liquid biopsy solutions for diagnosis, prognosis and treatment monitoring

🔬

Translasyonel Araştırma Laboratuvarları

Translational Research Labs

Hasta kaynaklı model ve multi-omik analiz desteği

Patient-derived model and multi-omic analysis support

💊

İlaç Geliştirme Ekipleri

Drug Development Teams

PDO tabanlı ilaç duyarlılık taraması ve AR-GE hizmetleri

PDO-based drug sensitivity screening and R&D services

🧪

Akademik Araştırma Grupları

Academic Research Groups

NGS analizi, biyoinformatik danışmanlık ve veri entegrasyonu

NGS analysis, bioinformatics consulting and data integration

🌱

Biyoteknoloji Girişimleri

Biotech Startups

Konsept kanıtlama ve platform doğrulama çalışmaları

Proof-of-concept and platform validation studies

🦠

Mikrobiyota Araştırmacıları

Microbiome Researchers

Metagenomik analiz ve mikrobiyota-hastalık ilişkilendirme çalışmaları

Metagenomic analysis and microbiome-disease association studies

İletişim
Contact

Projenizi Birlikte Tasarlayalım

Let's Design Your Project Together

Araştırma hedefinizi paylaşın, size özel çözüm önerimizi ileteyim.

Share your research goal and we'll get back to you with a tailored proposal.

📍
Adres
Address
GEMHAM Lab · Marmara Üniversitesi · İstanbul
GEMHAM Lab · Marmara University · Istanbul, TR
🤝
Klinik Ortaklık
Clinical Partnership
Memorial Göztepe Hastanesi